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小柳香奈子

 
アバター
研究者氏名小柳香奈子
eメールkkoyanagist.hokudai.ac.jp
URLhttp://www.ist.hokudai.ac.jp/div/bio/intro/genome/
所属北海道大学
部署大学院情報科学研究科
職名准教授
学位博士(理学)(京都大学)

研究キーワード

 
細胞分化 , 細胞系譜 , エピジェネティクス , イネ , ヒト , ウィルス , ゲノム , 進化 , 分子進化 , 発現制御 , ゲノム構造 , 比較解析

研究分野

 
  • 生物科学 / 進化生物学 / 
  • 情報学 / 生体生命情報学 / 
  • ゲノム科学 / 基礎ゲノム科学 / 

経歴

 
2007年
 - 
現在
北海道大学 大学院・情報科学研究科 准教授
 
2004年
 - 
2007年
北海道大学 大学院・情報科学研究科 助教授
 
2003年
 - 
2004年
奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 助手
 
2001年
 - 
2003年
生物情報解析研究センター 特別研究員
 
2000年
 - 
2001年
京都大学 大学院理学研究科 派遣研究員
 

受賞

 
2005年
第77回日本遺伝学会BP賞
 

論文

 
Jąkalski M, Takeshita K, Deblieck M, Koyanagi KO, Makałowska I, Watanabe H, Makałowski W
Biology direct   11 35   2016年8月   [査読有り]
Fujino K, Obara M, Shimizu T, Koyanagi KO, Ikegaya T
Breeding science   65(5) 403-410   2015年12月   [査読有り]
Gonzalez G, Koyanagi KO, Aoki K, Watanabe H
Journal of virology      2015年4月   [査読有り]
Abe Takatoshi, Watanabe Hidemi, Koyanagi Kanako O, Inoue Botaro
Genome   58(5) 185   2015年   [査読有り]
Chen S, Liu R, Koyanagi KO, Kishima Y
Virology   471-473C 141-152   2014年11月   [査読有り]
Gonzalez G, Koyanagi KO, Aoki K, Kitaichi N, Ohno S, Kaneko H, Ishida S, Watanabe H
Gene      2014年4月   [査読有り]
Fujimoto Tsuguto, Yamane Shotaro, Ogawa Tomoko, Hanaoka Nozomu, Ogura Atsushi, Hotta Chiemi, Niwa Takeshi, Chiba Yakou, Gonzalez Gabriel, Aoki Koki, Koyanagi Kanako Ono, Watanabe Hidemi
Japanese Journal of Infectious Diseases   67(5) 416   2014年   [査読有り]
Fujimoto T, Yamane S, Ogawa T, Hanaoka N, Ogura A, Hotta C, Niwa T, Chiba Y, Gonzalez G, Aoki K, Koyanagi KO, Watanabe H
Japanese journal of infectious diseases   67(4) 282-287   2014年   [査読有り]
Kanako O Koyanagi, Tadashi Imanishi, Takashi Gojobori
eLS. John Wiley & Sons, Ltd: Chichester      2013年12月   [査読有り][招待有り]
Yamane S, Lee AW, Hanaoka N, Gonzalez G, Kaneko H, Ishida S, Kitaichi N, Ohno S, Koyanagi KO, Aoki K, Fujimoto T, Yawata N, Watanabe H
Journal of virology   87(2) 1285-1286   2013年1月   [査読有り]
Liu R, Koyanagi KO, Chen S, Kishima Y
The Plant journal : for cell and molecular biology   72(5) 817-828   2012年12月   [査読有り]
Kaneko H, Aoki K, Ishida S, Ohno S, Kitaichi N, Ishiko H, Fujimoto T, Ikeda Y, Nakamura M, Gonzalez G, Koyanagi KO, Watanabe H, Suzutani T
The Journal of general virology   92(6) 1251-1259   2011年6月   [査読有り]
Kaneko H, Aoki K, Ohno S, Ishiko H, Fujimoto T, Kikuchi M, Harada S, Gonzalez G, Koyanagi KO, Watanabe H, Suzutani T
Journal of clinical microbiology   49 484-490   2011年2月   [査読有り]
Tanaka T, Koyanagi KO, Itoh T
Plant physiology   149(3) 1316-1324   2009年3月   [査読有り]
Matsuya A, Sakate R, Kawahara Y, Koyanagi KO, Sato Y, Fujii Y, Yamasaki C, Habara T, Nakaoka H, Todokoro F, Yamaguchi K, Endo T, Oota S, Makalowski W, Ikeo K, Suzuki Y, Hanada K, Hashimoto K, Hirai M, Iwama H, Saitou N, Hiraki AT, Jin L, Kaneko Y, Kanno M, Murakami K, Noda AO, Saichi N, Sanbonmatsu R, Suzuki M, Takeda J, Tanaka M, Gojobori T, Imanishi T, Itoh T
Nucleic acids research   36 D787-92   2008年1月   [査読有り]
Genome Information Integration Project And H-Invitational 2, Yamasaki C, Murakami K, Fujii Y, Sato Y, Harada E, Takeda J, Taniya T, Sakate R, Kikugawa S, Shimada M, Tanino M, Koyanagi KO, Barrero RA, Gough C, Chun HW, Habara T, Hanaoka H, Hayakawa Y, Hilton PB, Kaneko Y, Kanno M, Kawahara Y, Kawamura T, Matsuya A, Nagata N, Nishikata K, Noda AO, Nurimoto S, Saichi N, Sakai H, Sanbonmatsu R, Shiba R, Suzuki M, Takabayashi K, Takahashi A, Tamura T, Tanaka M, Tanaka S, Todokoro F, Yamaguchi K, Yamamoto N, Okido T, Mashima J, Hashizume A, Jin L, Lee KB, Lin YC, Nozaki A, Sakai K, Tada M, Miyazaki S, Makino T, Ohyanagi H, Osato N, Tanaka N, Suzuki Y, Ikeo K, Saitou N, Sugawara H, O'Donovan C, Kulikova T, Whitfield E, Halligan B, Shimoyama M, Twigger S, Yura K, Kimura K, Yasuda T, Nishikawa T, Akiyama Y, Motono C, Mukai Y, Nagasaki H, Suwa M, Horton P, Kikuno R, Ohara O, Lancet D, Eveno E, Graudens E, Imbeaud S, Debily MA, Hayashizaki Y, Amid C, Han M, Osanger A, Endo T, Thomas MA, Hirakawa M, Makalowski W, Nakao M, Kim NS, Yoo HS, De Souza SJ, Bonaldo Mde F, Niimura Y, Kuryshev V, Schupp I, Wiemann S, Bellgard M, Shionyu M, Jia L, Thierry-Mieg D, Thierry-Mieg J, Wagner L, Zhang Q, Go M, Minoshima S, Ohtsubo M, Hanada K, Tonellato P, Isogai T, Zhang J, Lenhard B, Kim S, Chen Z, Hinz U, Estreicher A, Nakai K, Makalowska I, Hide W, Tiffin N, Wilming L, Chakraborty R, Soares MB, Chiusano ML, Suzuki Y, Auffray C, Yamaguchi-Kabata Y, Itoh T, Hishiki T, Fukuchi S, Nishikawa K, Sugano S, Nomura N, Tateno Y, Imanishi T, Gojobori T
Nucleic acids research   36 D793-9   2008年1月   [査読有り]
Rice Annotation Project, Tanaka T, Antonio BA, Kikuchi S, Matsumoto T, Nagamura Y, Numa H, Sakai H, Wu J, Itoh T, Sasaki T, Aono R, Fujii Y, Habara T, Harada E, Kanno M, Kawahara Y, Kawashima H, Kubooka H, Matsuya A, Nakaoka H, Saichi N, Sanbonmatsu R, Sato Y, Shinso Y, Suzuki M, Takeda J, Tanino M, Todokoro F, Yamaguchi K, Yamamoto N, Yamasaki C, Imanishi T, Okido T, Tada M, Ikeo K, Tateno Y, Gojobori T, Lin YC, Wei FJ, Hsing YI, Zhao Q, Han B, Kramer MR, McCombie RW, Lonsdale D, O'Donovan CC, Whitfield EJ, Apweiler R, Koyanagi KO, Khurana JP, Raghuvanshi S, Singh NK, Tyagi AK, Haberer G, Fujisawa M, Hosokawa S, Ito Y, Ikawa H, Shibata M, Yamamoto M, Bruskiewich RM, Hoen DR, Bureau TE, Namiki N, Ohyanagi H, Sakai Y, Nobushima S, Sakata K, Barrero RA, Sato Y, Souvorov A, Smith-White B, Tatusova T, An S, An G, OOta S, Fuks G, Fuks G, Messing J, Christie KR, Lieberherr D, Kim H, Zuccolo A, Wing RA, Nobuta K, Green PJ, Lu C, Meyers BC, Chaparro C, Piegu B, Panaud O, Echeverria M
Nucleic acids research   36 D1028-33   2008年1月   [査読有り]
Sakai H, Koyanagi KO, Imanishi T, Itoh T, Gojobori T
Gene   389(2) 196-203   2007年3月   [査読有り]

Misc

 
飯田雅, 小柳香奈子, 日隈陸太郎, 青木功喜, 渡邉日出海
日本化学療法学会雑誌   65(Supplement-A) 379-379   2017年3月
富岡駿, 井上望太郎, 小柳香奈子, 渡邉日出海
日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web)   19th 112 (WEB ONLY)   2017年8月
青木慧斗, 小柳香奈子, 渡邉日出海
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   39th ROMBUNNO.2P‐0888 (WEB ONLY)   2016年
小松篤史, 小柳香奈子, 渡邉日出海
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   39th ROMBUNNO.3LBA‐006 (WEB ONLY)   2016年
西宮航, 小柳香奈子, 渡邉日出海
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   39th ROMBUNNO.2P‐0892 (WEB ONLY)   2016年
北市伸義, 北市伸義, 北市伸義, 北市伸義, 山根翔太郎, ゴンザレス ガブリエル, パント ローラ, 奥山雄一郎, 金子久俊, 青木功喜, 小柳香奈子, 渡邉日出海
日本眼感染症学会・日本眼炎症学会・日本コンタクトレンズ学会総会・日本涙道・涙液学会プログラム・講演抄録集   52nd-49th-58th-4th 67   2015年
藤野 賢治, 木内 均, 池ヶ谷 智仁, 小柳 香奈子
育種学研究   18(2) 72-77   2016年
小柳香奈子
日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web)   17th ROMBUNNO.P‐55 (WEB ONLY)   2015年8月
池ケ谷智仁, 小柳香奈子, 清水敏明, 品田博史, 西村努, 平山裕治, 木内均, 前川利彦, 佐藤毅, 藤野賢治
育種学研究   16 39   2014年9月
藤野賢治, 小柳香奈子, 佐藤毅
育種学研究   16 12   2014年3月

書籍等出版物

 
ニコラス・H. バートン, ジョナサン・A. アイゼン, デイビッド・B. ゴールドステイン, ニパム・H. パテル, デレク・E.G. ブリッグス
メディカルサイエンスインターナショナル   2009年12月   ISBN:4895926214

講演・口頭発表等

 
Inferring cell differentiation processes based on phylogenetic analysis of genome-wide epigenetic information
Kanako O. Koyanagi
SMBE 2018   2018年7月11日   
エピゲノム情報の系統解析による細胞分化過程の推定 —哺乳類の血球系細胞分化をモデルとして [招待有り]
小柳香奈子
分子生物学会   2017年12月7日   
Inferring cell differentiation processes based on phylogenetic analysis of genome-wide epigenetic information
Kanako O. Koyanagi
CDB symposium 2017   2017年3月27日   
Inferring cell differentiation processes based on phylogenetic analysis of genome-wide epigenetic information
Kanako O. Koyanagi
THE 40th NAITO CONFERENCE on Epigenetics―From Histone Code to Therapeutic Strategy   2015年9月17日   
新規遺伝子同定法 FATES;その特徴と今後の展開 「基盤整備~専用解析プログ ラムFATESerの開発」
小柳香奈子
日本育種学会 第128回講演会・新潟   2015年9月11日   
ヒストン修飾情報の系統解析による細胞分化過程の推定 ーヒト血球系細胞をモデルとして
小柳香奈子
日本進化学会 第17回大会・東京   2015年8月22日   
Inferring cell differentiation processes based on the phylogenetic analysis of genome-wide DNA methylation data: Hematopoiesis as a model case
Kanako O. Koyanagi
Keystone Symposia Conference (Z1: DNA Methylation)   2015年3月31日   
アデノウイルスのゲノム進化を可能にする組換えと置換の特徴 [招待有り]
小柳香奈子
第15回アデノウィルス研究会 品川インターシティ   2014年11月8日   
エピジェネティック情報の最尤推定による細胞分化過程の推定 ーマウス血球系細胞をモデルとして
小柳香奈子
日本進化学会 第16回大会・高槻   2014年8月22日   
エピジェネティック情報の系統解析による細胞分化過程の推定 ーマウス血球系細胞をモデルとして
小柳香奈子
日本分子生物学会 第36回・神戸   2013年12月5日   

担当経験のある科目

 
  • 生体情報工学実験Ⅰ (北海道大学 工学部)
  • 情報科学特論 (北海道大学 大学院獣医学研究科)
  • ゲノム情報科学特論 (北海道大学 大学院情報科学研究科)
  • ゲノム情報科学応用特論 (北海道大学 大学院共通授業科目)
  • 情報学Ⅰ (北海道大学 全学教育)
  • 生体情報工学演習Ⅱ (北海道大学 工学部)
  • 生体情報工学実験Ⅱ (北海道大学 工学部)
  • 外国語演習 (北海道大学 全学教育)
  • 生体機能学 (北海道大学 工学部)
  • 一般教育演習 ゲノムを考える (北海道大学 全学教育)
  • 細胞生物学 (北海道大学 工学部)
  • 生物学Ⅰ (北海道大学 全学教育)

競争的資金等の研究課題

 
体細胞ヒストン修飾情報の系統解析によるヒトの細胞系譜および細胞分化過程の推定
文部科学省: 科学研究費補助金(基盤研究(C))
研究期間: 2016年4月 - 2019年3月    代表者: 小柳香奈子
地域の育種集団におけるFNPsハプロタイプを用いた高速ゲノム育種法の開発
農林水産省: 農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業 シーズ創出ステージ
研究期間: 2013年 - 2016年3月    代表者: 藤野 賢治
文部科学省: 科学研究費補助金(基盤研究(C))
研究期間: 2013年4月 - 2016年3月    代表者: 小柳 香奈子
文部科学省: 科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型), 新学術領域研究(研究領域提案型))
研究期間: 2010年 - 2014年    代表者: 渡邉 日出海
文部科学省: 科学研究費補助金(若手研究(B))
研究期間: 2006年 - 2008年    代表者: 小柳 香奈子
文部科学省: 科学研究費補助金(特定領域研究)
研究期間: 2006年 - 2007年    代表者: 渡邉 日出海
文部科学省: 科学研究費補助金(若手研究(B))
研究期間: 2004年 - 2005年    代表者: 小柳 香奈子
文部科学省: 科学研究費補助金(特定領域研究)
研究期間: 2004年 - 2004年    代表者: 渡邉 日出海

委員歴

 
2016年
 - 
現在
日本進化学会  2019年大会準備委員
 
2016年
 - 
2017年
IIBM2017  実行委員
 

社会貢献活動

 
RIKEJO CAFE
【取材協力】  2017年3月15日 - 2017年3月15日
北大セミナー in オホーツク2015
【講師】  2015年10月10日
北海道大学 公開講座
【講師】  2014年7月31日
日本植物学会 第4回男女共同参画セミナー
【パネリスト】  2013年9月13日
日本遺伝学会 男女共同参画ランチョンワークショップ
【パネリスト】  2010年9月21日
第47回サイエンス・カフェ札幌
【出演】  2009年10月3日
北海道大学 女性研究者支援室開設記念シンポジウム
【パネリスト】  2006年7月25日