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Mathematics, Physics

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MITSUTAKE AYORI

 
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NameMITSUTAKE AYORI
e-mailayorimeiji.ac.jp
AffiliationMeiji University
SectionSchool of Science and Technology
Degree博士(理学)(The Graduate University for Advanced Studies)

Research Interests

 
ダイナミクス , 分子シミュレーション , 生体高分子 , 統計物理学 , 拡張アンサンブル法 , 緩和モード解析

Research Areas

 
  • Biological Science / Biophysics / 
  • Physics / Biological physics/Chemical physics/Soft matter physics / 
  • Informatics / Life/Health/Medical informatics / 

Academic & Professional Experience

 
Apr 2001
 - 
Mar 2012
Assistant Professor
 
Apr 2006
 - 
Mar 2007
Sabbatical in Professor Charles L. Brooks,III Group, Department of Molecular Biology, The Scripps Research Institute
 
Apr 2012
   
 
大学専任講師
 
Oct 2013
 - 
Mar 2017
さきがけ研究者(併任)
 

Committee Memberships

 
Jan 2010
 - 
Dec 2011
日本生物物理学会  Editor
 
Apr 2005
 - 
Mar 2007
蛋白質科学会  Director
 

Awards & Honors

 
Nov 2013
多次元焼き戻し法の開発及び緩和モード解析とWHAM法の一般化による構造解析法の開発, 学術賞, 分子シミュレーション研究会
 
Mar 2013
生体分子系で有効な拡張アンサンブル法及び構造解析法の開発, 物理学会若手奨励賞(領域12), 日本物理学会
 

Published Papers

 
Mitsutake Ayori, Takano Hiroshi
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS   151(4)    Jul 2019   [Refereed]
Karasawa Naoyuki, Mitsutake Ayori, Takano Hiroshi
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS   150(8)    Feb 2019   [Refereed]
Fujisaki Hiroshi, Moritsugu Kei, Mitsutake Ayori, Suetani Hiromichi
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS   149(13)    Oct 2018   [Refereed]
Maruyama Yutaka, Mitsutake Ayori
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   122(14) 3801-3814   Apr 2018   [Refereed]
MITSUTAKE AYORI, TAKANO HIROSHI
Biophys Rev.   10 375-389   Apr 2018   [Invited]

Misc

 
Effective Sampling Algorithms and Analysis Methods for Molecular Simlations of Proteins
<U>MITSUTAKE AYORI</U>
日本物理学会学会誌   70(3)    Mar 2015   [Refereed][Invited]
<U>MITSUTAKE AYORI</U>
分子シミュレーション研究会会誌"アンサンブル"   16(1) 1   Feb 2014   [Refereed][Invited]

Books etc

 
Biomolecular Simulations: Methods and Protocols
A. Mitsutake, Y. Mori, and Y. Okamoto (Part:Joint Work)
2012   

Conference Activities & Talks

 
分子動力学法を用いたタンパク質の緩和モード解析II
唐澤直之、光武亜代理、高野宏
日本物理学会2017年年次大会   19 Mar 2017   日本物理学会
生体分子の分子シミュレーションから反応座標をどう抜き出すか?
藤崎弘士、末谷大道、光武亜代理
日本物理学会2017年年次大会   19 Mar 2017   日本物理学会
緩和モード解析による200残基程度の蛋白質のマイクロ秒程度の分子シミュレーションの動的解析
光武亜代理、竹内恒、高野宏
日本物理学会2017年年次大会   19 Mar 2017   日本物理学会
リングポリマーブラシの静的・動的特性
川島聡、高野宏、光武 亜代理
日本物理学会2017年年次大会   19 Mar 2017   日本物理学会
Improved Relaxation Mode Analysis of a Hen Egg-white Lysozyme Protein
KARASAWA NAOYUKI, MITSUTAKE AYORI, TAKANO HIROSHI
Biophysical Society 61st Annual Meeting   14 Feb 2017   

Association Memberships

 
分子シミュレーション研究会 , 日本生物物理学会 , 日本物理学会 , 蛋白質科学会

Research Grants & Projects

 
緩和モード解析によるタンパク質構造ダイナミクスの解明
Precursory Research for Embryonic Science and Technology
Project Year: Oct 2013 - Mar 2017    Investigator(s): 光武亜代理
緩和モード解析による蛋白質の構造揺らぎの動的特徴
慶應義塾大学: 学事振興資金(個人研究 特B)
Project Year: Apr 2013 - Mar 2014    Investigator(s): 光武亜代理
物理化学的手法を用いた免疫系のペプチドの分子認識に対するシステムの構築
KLL指定研究プロジェクト
Project Year: 2010 - 2011
多自由度・大規模系における反応と構造空間探索
新学術領域研究(研究領域提案型)「コンピュティクスによる物質デザイン:複合相関と非平衡ダイナミクス」: Grant-in-Aid for Scientific Research
Project Year: Sep 2010 - Mar 2014
多自由度・大規模系における反応と構造空間探索
新学術領域研究(研究領域提案型)「コンピュティクスによる物質デザイン:複合相関と非平衡ダイナミクス」: Grant-in-Aid for Scientific Research
Project Year: Sep 2010 - Mar 2014

Others

 
Nov 2014
Organizing Committe (Vice Chair) of International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling: Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30)